Als oberstes Mitwirkungsgremium einer Schule berät und beschließt die Schulkonferenz grundsätzliche Angelegenheiten der Schule. Hierzu zählen unter anderem das Schulprogramm und die Schulordnung, der Schulhaushalt, die Einführung neuer Unterrichtsformen und Unterrichtsmaterialien ebenso wie der Umfang und die Verteilung von Hausaufgaben und Klassenarbeiten sowie die Wahl der Schulleiterin bzw. des Schulleiters. 

Zudem kann die Schulkonferenz Vorschläge und Anregungen an den Schulträger und an die Schulaufsichtsbehörde richten. 

Neben den bereits bei der Schulpflegschaft genannten Themen seien hier aufgezählt

• Gestaltung der Stundentafel in der Kooperation der Recklinghäuser Gymnasien

• Beschluss „rauchfreies Petrinum“ in 2006

• Fortschreiben des Schulprogramms

• Entsenden einer Vertreterin bzw. eines Vertreters in Auswahlkommissionen zur Einstellung neuer Lehrer/innen

Die Schulkonferenz des Petrinum hat zurzeit insgesamt 18 Mitglieder, die nach dem Schlüssel 1:1:1 auf Lehrer, Schüler und Eltern verteilt sind. Die Elternvertreter der Schulkonferenz werden durch die Schulpflegschaft, die Schülervertreter durch die Schülervertretung und die Lehrervertreter durch die Lehrerkonferenz gewählt.